以下の国の補助金とは、その目的・補助対象が本事業と重複することから、併用することはできません。

①住宅・建築物安全ストック形成事業（地方公共団体が耐震診断や耐震改修の補助を実施）
②地域型住宅グリーン化事業（国土交通省が実施）
③ネット・ゼロ・エネルギー・ハウス（ZEH）支援事業（経済産業省が実施）
④ZEH化による住宅における低炭素化促進事業（環境省が実施）
⑤次世代省エネ建材支援事業（経済産業省が実施）
⑥高性能建材による住宅の断熱リフォーム事業（環境省、経済産業省が実施）

また、次世代住宅ポイント制度については、工事請負契約が同じである場合は併用できません。

上記以外の国の補助金については、双方の補助対象工事の箇所が重複する場合は併用できません。

なお、地方自治体の単独費による補助金であれば併用可能です。　
地方自治体の補助金の一部に国費が充当されているか否かについては、当該地方自治体にお問い合わせください。

工事請負契約が別であって、かつ、工事期間も重複しない場合は活用可能です。

ただし、過去に補助金の交付を受けている住宅や設備については、今回のリフォーム工事で撤去等をすることにより、過去に受けた補助金について返還の必要が生じないか、当該補助金の実施主体に確認した上で、本事業の実施を検討してください。

地方公共団体が実施している「住宅・建築物安全ストック形成事業」とは、耐震診断や耐震改修の一部に補助するもので、地方公共団体の予算のほか、国の予算も含まれており、補助は地方公共団体で受け付けられ交付されます。　

補助事業の名称は地方公共団体により異なりますが、耐震診断や耐震改修に対する補助事業は一般的にはこれに該当します。

併用可能です。
税制特例の詳細については、以下のアドレスを参照してください。
http://www.mlit.go.jp/jutakukentiku/house/jutakukentiku_house_fr2_000011.html

災害救助法に基づく「住宅の応急修理」に対する援助と併用する場合にあっては、「援助」と補助事業とで、それぞれの対象とする経費が重複しないようにすれば併用は可能です。

被災者生活再建支援法に基づく「支援金（加算支援金含む）」を受けた場合に、補助事業と併用することは可能です（「住宅の応急修理」に対する援助のように対象経費を仕分ける必要はありません）。